宋金元时期，道教医家在传统医学建设中发挥了重要作用，他们在方剂、本草研究以及古籍注释整理等方面取得显著成就。全真道创始人王重阳不仅擅长医疗技术，还以此传教，其医术被赞誉为“一见师真涸疾顿愈”。马钰作为王重阳的高足，以针灸闻名，有《马丹阳天星十二穴治杂病歌》。刘处玄则建立了随山派，对医术有着特别的重视。
邱处机、王重阳、刘处玄等全真七真的养生理论与实践同样值得称道。邱处机强调顺应自然规律，反对长生不死之药。他撰写《摄生消息论》，阐述了养生的科学原理和方法。此外，还有许多其他道教医学著作，如《混俗颐生录》、《泰定养主论》、《三元延寿参赞书》，这些作品对道教养生学体系的发展产生了深远影响。
金元四大家中的刘完素是一位 道士，他提出“火热论”，认为降心火、益肾水是治疗疾病的关键。在这之前，北宋时期，道士们参与编修了一系列官方医书，如《开宝新详定本草》和《太平圣惠方》，这些工作对于后世的医学发展具有重要意义。
在脉学领域，也有一些创新出现，比如张伯端对奇经八脉进行新的解读，而崔嘉彦则提出了“四脉为纲”的新理论，这些都丰富了传统经络学说。此外，还有很多其他文人的作品，他们通过诗句来表达修行之意，使得文人墨客也能感受到宗教文化中的哲学深度。
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