孙恩（？～402），东晋五斗米道之主，字灵秀。祖籍琅琊，家族世奉五斗米道，是永嘉南渡世族。其叔父孙泰奉吴郡钱塘五斗米道首领杜子恭为师。杜子恭死后，孙泰继传杜子恭道法，受人敬信。东晋黄门郎孔道、鄱阳太守桓放之、骠骑谘议周勰等皆敬事孙泰。
东晋隆安二年（398），爆发王恭之乱，孙泰以为晋祚将尽，乃以讨王恭为名，私合徒众数千人准备起事。但事未发，被司马道子父子诱斩及其六子后逃入海岛，与百余名信徒立志为孙泰复仇。
隆安三年，因民心骚动与免奴政策的实施，加上会稽内史、五斗米道徒王凝之的杀害，使得人民群起响应，“旬日之中，众数十万”。①他占领了会稽八郡，并自称“征东将军”，置官职，将部下称为“长生人”。
此时，一度影响了整个建康地区，以至于内外戒严，并引发了一系列连锁反应。②最终，由谢琰率军进行镇压，但在这场战役中，也有许多妇女为了避免被俘而投水自尽。“其妇女有婴累不能去者，将婴儿投水，而告曰：‘贺汝先登仙堂，我寻后就汝’”③
随着战争的继续激烈化和给养困难加上疫病流行，“死者大半”，最终在元兴元年（402）三月，他进攻临海失败后选择自沉于海中。在他的遗体被发现之后，有信徒认为他已成“水仙”，从而进一步增强了对他的神秘色彩。而卢循则继续领导义军，最终在义熙七年（411）失利。
作为一个坚定信仰天地水三官及特别是水仙的人物，他利用五斗米道组织起义，对当时的政治环境造成了深远影响，不仅动摇了晋室封建统治，而且促使南北朝时期出现冠谦之、陆修静等对道教改革，以及南北天师 道的出现。此外，《隋书·经籍志》记载有《孙恩集》五卷，但已经散佚不见今日踪迹。
