孙恩（？～402），东晋五斗米道的传奇人物，字灵秀。其家族世奉五斗米道，是永嘉南渡时期的世族。孙恩之叔父孙泰，曾受杜子恭为师，并继承了他的道法，被人敬信。在东晋时期，许多官员，如孔道、桓放之、周勰等，都尊敬孙泰。
然而，在王恭之乱爆发后，尽管事未能成行，但司马道子父子却诱杀了孙泰及其六个儿子。这使得孙恩逃往海岛，并在那里聚集了一百多名追随者，他们共同誓言为复仇而战。
当司马元显发起“乐属”政策，让奴隶免役并迁往京城充军时，民心开始动荡。孙恩趁机率领部下攻占上虞并继续北进，最终杀死会稽内史和五斗米道徒王凝之。随着他的胜利，“旬日之间”，他领导的起义军迅速扩大到数十万人，从而控制了会稽八郡。
作为征东将军，他设立官职，并号称长生人，与朝廷展开对抗。当谢琰率领重兵讨伐时，他带领数十万妇女及儿童撤退至海岛，最终在隆安四年自沉于海中，被信徒认为已经成为水仙，从而投入水中自尽的人数超过一百人。此后，其余忠实支持者的残余力量被卢循领导，一度占据广州并进行北伐，但最终在411年失败结束。
作为五斗米道的一分子，孙恩深信长生久视之术，以及天地水三官神祗。他通过组织起义，对抗了东晋政权，同时也促进了南北朝时期对宗教改革的探索和天师道的兴起。而关于他的著作《孙恩集》虽有记载，却早已失传。
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