孙恩（？～402），东晋五斗米道的传奇领袖，字灵秀。他的家族源自琅琊（今山东胶南县境南），世代奉行五斗米道，是永嘉南渡后的一支重要族群。孙恩的叔父孙泰受杜子恭为师，继承其道法，被人尊敬信仰。在东晋时期，他的家族与朝廷官员如孔道、桓放之、周勰等都有交往。
然而，在隆安二年（398年），王恭之乱爆发，孙泰被诱杀及其六子，而孙恩逃到海岛，聚集一百多名信徒，以复仇为名准备起义。第二年，他趁民心浮动之机，从海岛攻下上虞，再破会稽，将会稽内史王凝之杀死。这次行动迅速得到八郡人民的响应，“旬日之间众数十万”。
随着势力扩大，孙恩自称“征东将军”，设立官职，并号称自己的追随者为“长生人”。他向朝廷提出诛杀会稽王道子和元显父子的请求，但遭到了拒绝。此时，全晋戒严，有潜伏在建康的人士也引起了人们对潜在危险的担忧。
为了镇压这场起义，最终派出谢琰率重兵讨伐。当时，一些妇女甚至以婴儿投水自尽，以示不愿被俘，这显示了他们对于自由生活和宗教信仰的坚持。而最终，在隆安四五年的战斗中，由于给养困难和疫病流行，大量士兵丧命。
最后，在元兴元年三月（402年）三月，尽管战事仍然激烈，但由于资源枯竭，加上个人健康问题，最终决定赴海自沉。他的信徒们认为他已经成为了“水仙”，并从死亡中获得解脱，而一些余部则推举卢循继续领导反抗。
作为一个崇尚长生久视而且相信天地水三官的人物，孙恩通过组织五斗米道力量进行起义，对当时封建统治产生了重大影响，同时也促使了一系列关于改革和天师道出现的问题。在隋朝记载中，《隋书·经籍志》曾记载《孙恩集》的存在，但已佚失。不过，即便是这个故事，也留下了对历史的一个深刻印象：一个由宗教信仰驱动的小规模起义如何迅速发展成一股席卷全国的大浪潮，以及它所带来的社会变革与政治震荡。
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