孙恩（？～402），东晋五斗米道的重要人物，起义军首领，以字称灵秀，祖籍琅琊（今山东胶南县境南）。家族世奉五斗米道，是永嘉南渡后的世族。其叔父孙泰受杜子恭为师后，继承了杜子恭的道法，被人敬信。东晋中期，他的叔父孙泰因王恭之乱未能成事被杀，其弟孙恩逃入海岛，与数百名信徒聚集。
隆安三年，当时会稽王世子司马元显发动“乐属”政策移民京师充兵役，这激起了民众不满。在这个机会下，孙恩率众攻克上虞、破会稽，并杀死内史王凝之。随着他的成功，一系列郡县响应，最终他控制了八个郡。
自称征东将军后，孙恩建立官职，并号称长生人。他上表要求诛杀会稽王道子和元显父子，但最终遭到了谢琰率领的重兵讨伐。尽管有多次冲突，最终由于给养不足、疫病流行以及对抗官军持续失败，加之个人健康问题，最终在隆安四五年末，在临海的一场战斗中失利而自沉。
然而，此事件并没有结束，他妹夫卢循继续领导剩余的义军并进行抵抗，最终于义熙七年（411）被平定。此事件虽然最终以失败告结，但它却是对当时社会经济结构的一个巨大打击，也推动了道教内部改革和新的宗派出现，如冠谦之、陆修静等人的影响，以及南北天师道的兴起。《隋书·经籍志》记载有《孙恩集》五卷，但已散佚。这段历史也反映出一个国家内部矛盾与外部压力之间微妙关系，以及宗教信仰如何在政治变革中扮演角色。
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