孙恩（？～402），东晋五斗米道的重要代表人物，起义军首领。他的家族世奉五斗米道，是永嘉南渡后的一支世族。孙恩的叔父孙泰是杜子恭的弟子，后来继承了杜子的道法，被人尊敬。许多官员，如孔道、桓放之、周勰等，都敬仰孙泰。
当王恭之乱爆发时，孙泰利用讨伐王恭为名，私下聚集了几千名信徒准备起事。但在司马道子父子的诡计下，他被杀，并且他的六个儿子也遭到了同样的命运。孙恩逃到海岛上，与数百名信徒一起寻求复仇。
在民心不稳定的情况下，会稽王世子司马元显发布了一项免役令，让东土各郡的人成为“乐属”，并将这些人移至京师充当兵役。这让民众感到更加不满。当时机成熟时，孙恩率领着一支由海岛上的信徒组成的队伍攻克了上虞，并继续扩大他的势力。他自称“征东将军”，建立了一套官职体系，并号称自己和追随者为“长生人”。
随着会稽八郡人民加入起义，最终形成一个庞大的反抗力量。然而，当谢琰率领重兵前来镇压，这场起义最终失败了。在多次战斗中，一些女性为了追随他们所爱的人而投身水中，而其他一些则因为饥饿和疾病而死亡。
最终，在隆安四五年间，由于给养短缺和疫病流行，加上政府加强防务，这场起义逐渐衰败。在元兴元年（402）三月，由于进攻临海失败，孙恩选择自沉 海中。而他的支持者们认为他已经达到“水仙”的境界，从而有更多的人跟随他进入水中去寻找灵魂解脱。
尽管如此，一部分支持者的领导权交由卢循接手，他们继续战斗直到被迫撤退。此后的历史显示出，这场以五斗米道为基础的大规模叛乱对朝廷产生了深远影响，不仅动摇了封建统治，还促使出现新的宗教组织，比如冠谦之和陆修静对天师道的改革，以及南北天师道的兴起。不过关于孙恩自己的著作《孟昶集》已佚失今存残篇未能留传下来。
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