孙恩（？～402），东晋五斗米道的传奇人物，字灵秀。其家族世奉五斗米道，是永嘉南渡后的一支重要世族。孙恩的叔父孙泰曾受杜子恭为师，并继承了他的道法，被人们敬信。在东晋时期，许多官员，如孔道、桓放之、周勰等，都尊敬孙泰。
然而，在王恭之乱爆发后，尽管事未能成行，司马道子父子却趁机诱杀了孙泰及其六子。这一事件极大地激怒了孙恩，他逃到海岛上，与一些忠心耿耿的随从聚集在一起，以复仇为目的。
当时，由于民心不满和社会动荡，一场起义在会稽地区爆发。孙恩乘机率领起义军攻克上虞，并成功击败了会稽内史王凝之。此举迅速赢得了八郡人民的支持，“旬日之间”便有数十万人响应。他自称“征东将军”，建立了一套官职制度，并号称其追随者为“长生人”。
此时，东晋政府派谢琰带兵讨伐，但遭到了坚决抵抗。在一次战斗中，起义军妇女为了让孩子先行而投入水中，对他们说：“贺汝先登仙堂，我寻后就汝。”最终，在隆安四年十二月，谢琰击败并杀死许允之，此役结束后，其余部队则继续向钱塘江推进。
面对即将逼近建康城的情况，加强防御和疫病流行导致给养困难以及大量士兵死亡，最终导致起义失败。元兴元年三月（402年），孙恩投水自尽，而他的信徒们则认为他已经成为了“水仙”，跟着他跳入水中的百余人也跟随而去。
卢循成为新任领袖继续领导残存的义军，他们占据广州并进行北伐，但直至義熙七年（411）被平定。这场由五斗米道所引发的大规模叛乱，不仅动摇了东晋政权，也促使南北朝时期出现天师道改革，以及《隋书·经籍志》记载有《孙恩集》五卷，这些都反映出宗教与政治力量之间复杂的互动关系。
